داستان بازی تقریبا برای همه واضح است، شما در نقش جوئل میلر (Joel Miller) ظاهر میشوید که باید در آخرالزمانی با طعم زامبی زنده بماند، البته این موجودات در انواع و اقسام متفاوتی به مصاف شما خواهند آمد. جوئل با دخترکی به نام الی ویلیامز (Ellie Williams) آشنا میشود که انگار در برابر ویروسِ همهگیر ایمنی دارد و حتی اگر توسط زامبیها گاز گرفته شود، اتفاقی برایش نمیافتد. یکی از گروهکهای خودجوش و مبارز که Fireflies نام دارد، از وجود الی و قدرت او باخبر میشود و جوئل ماموریت پیدا میکند که الی را به دست این گروه برساند، تا با انجام آزمایشهایی روی او، پادزهر و واکسن را تولید کنند تا جهان از دست هیولاهای آخرالزمانی نجات یابد. داستان بازی The Last of Us Part 1 قطعا نقطه قوت آن است و روایتی سینمایی هم دارد که طرفداران آثار ناتیداگ با آن آشنا هستند. در ریمیک بازی شاهد هیچ تغییری در خط داستانی یا جزئیات آن نخواهیم بود، قصه به همان شکلی که بوده روایت خواهد شد.